El segundo tanto del conjunto ‘colchonero' fue obra del argentino Sergio Agüero a los 83 minutos.
En el Atlético no actuó el defensor colombiano Luis Amaranto Perea, quien ha sido relegado a la banca por el entrenador Abel Resino.
El equipo griego terminó con diez hombres el enfrentamiento, debido a una expulsión de Cissé a los 72 minutos.
Como otro hecho destacado, el atacante uruguayo Diego Forlán completó cien partidos oficiales vistiendo la camiseta del Atlético.
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La fase de grupos de la Liga de Campeones comenzará el 15 de septiembre y finalizará el 9 de diciembre.
Otros resultados
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Anderlecht 1 - 3 Lyon*
Debrecen* 2 - 0 Levski Sofia
Maccabi Haifa* 3 - 0 RB Salzburg
Zurich* 2 - 1 Ventspils (un tanto del Zurich fue del colombano Johan Volanten)
*Clasificados